為什么銀染實(shí)驗(yàn)要用EDI水?
SDS聚丙烯酰胺凝膠染色是蛋白質(zhì)研究的一個(gè)基礎(chǔ)方法。染色方法有很多,實(shí)際應(yīng)用中,考馬斯亮藍(lán)染色(考染)和銀染是運(yùn)用的最多的方法。考馬斯亮藍(lán)G250在游離狀態(tài)下呈紅色,它與蛋白質(zhì)結(jié)合后變?yōu)樗{(lán)色,結(jié)合物在595 nm波長(zhǎng)下有最大光吸收。其光吸收值與蛋白質(zhì)含量成正比,因此可用于蛋白質(zhì)的定量測(cè)定。
銀染實(shí)驗(yàn)中,在堿性條件下,銀離子被還原成金屬銀,沉淀在蛋白質(zhì)的表面上顯色。蛋白電泳后的 SDS-聚丙烯酰胺凝膠在甲醇溶液中浸泡后,水洗后用硝酸銀溶液銀染,再水洗后用碳酸鈉甲醇水溶液顯色。
與考染相比,銀染具有靈敏度高的優(yōu)點(diǎn),很多做環(huán)境、植物、育種等方面的客戶,都會(huì)做銀染方面的實(shí)驗(yàn)。銀染對(duì)于試劑的要求比較高,尤其對(duì)其中使用純水的水質(zhì)要求比較高。
一、儀器和試劑
乙酸(1%),顯影液(2.5%碳酸鈉和0.02%甲醛水溶液),乙醇(30%),固定液(乙醇:冰醋酸:水(30:10:60)),硝酸銀溶液(0.1%),顯影液(將溶液A在850 mL去離子水中加入37 g NaCl和37 g CuSO4,再加入濃氨水直到深藍(lán)色沉淀形成然后溶解,定容至1 L)和溶液B(在900 mL去離子水中加入436 g 硫代硫酸鈉,定容至1 L)混合,加三倍水稀釋,立即使用
二、試驗(yàn)方法
1. 通過(guò)SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳分離蛋白質(zhì);
2. 將凝膠浸泡在至少5倍體積的固定液中,室溫下平緩搖動(dòng)4 - 12 h,使蛋白固定;
3. 棄去固定液,加至少5倍體積的30%乙醇,室溫下平緩搖動(dòng)30 min;
4. 重復(fù)步驟3;
5. 棄去乙醇,加10倍體積的純水(去離子水),室溫下平緩搖動(dòng)10 min;
6. 重復(fù)步驟5兩次;
7. 棄去清洗用水,加5倍體積的硝酸銀溶液,室溫下平緩搖動(dòng)30 min;
8. 棄去硝酸銀溶液,用純水(去離子水)漂洗凝膠兩面,每面20 s;
9. 加5倍體積的新鮮顯影液,室溫下平緩搖動(dòng),數(shù)分鐘內(nèi)出現(xiàn)蛋白質(zhì)的染色條帶,繼續(xù)至條帶清晰;
10. 用1%乙酸清洗凝膠終止反應(yīng),再用純水(去離子水)水漂洗數(shù)次,每次10 min。
銀染后的凝膠可以通過(guò)凝膠成像系統(tǒng)或掃描儀轉(zhuǎn)化為照片,或者可以直接用手機(jī)拍攝。
在銀染實(shí)驗(yàn)中,純水(去離子水)水質(zhì)非常重要,對(duì)實(shí)驗(yàn)成功與否起著關(guān)鍵性的作用。有用戶在實(shí)驗(yàn)中忽略了這一點(diǎn),純水水質(zhì)不佳,導(dǎo)致氯離子含量超標(biāo),浸泡時(shí)出現(xiàn)硝酸銀沉淀,沉淀在膠上,最后顯影的時(shí)候看到的是一片花花的亂象,影響了染色效果。
氯化銀的溶解度通常是2 ppm,氯離子是水中常見(jiàn)的一種離子雜質(zhì),如果水中的氯離子超過(guò)2 ppm,即有可能出現(xiàn)雜質(zhì),也就是說(shuō),對(duì)于銀染實(shí)驗(yàn),對(duì)于純水質(zhì)量的要求還是比較苛刻的,一般的反滲透純水(RO)設(shè)備,還難以達(dá)到要求。
另外,水中的顆粒物也會(huì)吸附銀離子沉淀顯色,污染背景,甚至讓好好的凝膠成了“大花臉”。因此制備出來(lái)的純水在使用前,還應(yīng)該通過(guò)0.22或0.45μm的過(guò)濾器預(yù)先過(guò)濾,以去除水中的顆粒物。
專業(yè)來(lái)講,銀染用水應(yīng)該盡量選用符合國(guó)標(biāo)《分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法》(GB/T 6682-2008二級(jí)純水以上的水—電導(dǎo)率至少應(yīng)當(dāng)在 1 μS/cm以下。
因此,銀染用水應(yīng)當(dāng)使用EDI純水或者超純水,而RO 純水是不能滿足銀染用水需求。
國(guó)內(nèi)做實(shí)驗(yàn)室EDI純水設(shè)備的廠家很少。滲源是國(guó)內(nèi)最早生產(chǎn)EDI實(shí)驗(yàn)室純水設(shè)備的供應(yīng)商。滲源新一代SYH智能型一體化超純水系統(tǒng)可以同時(shí)制備EDI 純水和超純水。SYH生產(chǎn)的 EDI 純水水質(zhì)完全滿足銀染實(shí)驗(yàn),還可以用來(lái)配制其他相關(guān)實(shí)驗(yàn)的試劑;超純水可以應(yīng)用于銀染實(shí)驗(yàn)的上下游以及其他蛋白質(zhì)研究實(shí)驗(yàn),例如蛋白SDS-PAGE電泳、Western Blotting等。取水終端安裝的終端微濾器,可以制備無(wú)熱原(內(nèi)毒素)、核酸酶、細(xì)菌的超純水,用于生化分析和分子生物學(xué)。
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